Di tahun 2004, Honda resmi melepas embel-embel ‘Astrea’ di keluarga Supra-nya. Hal itu ditandai dengan kehadiran Supra Fit yang merupakan produk downgrade dari varian X.
Selang setahun kemudian, Honda Supra FIT R diluncurkan, yang hadir lebih sporty berkat velg racing. Di masanya, motor ini terbilang laris bagai kacang goreng.
Honda Supra X 125
Di generasi inilah, boleh dibilang, Supra mengalami perubahan paling signifikan. Setelah bertahan selama tujuh tahun menggunakan mesin 100cc, Honda coba meningkatkan kapasitasnya menjadi 125cc.
Supra X 125 merupakan keluarga Supra yang paling sering mengalami pembaruan. Mulai dari varian D yang berarti standar, kemudian Racing (R), dan terakhir Helm-in.
Di saat yang bersamaan, Honda juga mulai mengenalkan teknologi PGM-FI yang diklaim lebih hemat bahan bakar, dan masih digunakan hingga sekarang.