Motor matik dengan sistem pengabutan karburator itu dilengkapi pengereman ganda, atau disebut CBS (Combi Brake System), saat handle rem depan di tekan, otomatis rem belakang berfungsi dan pertama kalinya dimiliki Honda.

Mengikuti perkembangan zaman akan tingkat efisiensi, dan emisi, maka pada 2013 pabrikan berlogo sayap mengepak itu merilis Vario PGM-FI, atau nama teknologi sistem pengabutan injeksi Honda menggantikan karburator.

Jantung pacunya bertambah besar menjadi 125cc, desainnya masih agak mirip dengan Techno dengan garis serba melancip pada bagian depan, hingga bodi belakang. Mesin barunya memiliki tenaga 11,3 PS, dan torsi 10,7 Nm.

Honda Vario dengan desain lama seperti generasi pertama masih dipertahankan hingga 2015 muncul edisi 110 eSP. Pada saat itu, Honda juga menawarkan model terbaru dengan mesin yang lebih besar, yaitu berkubiasi 150cc.

Saat ini Honda Vario yang dijual menggunakan mesin 160cc, serupa dengan PCX, dan ADV. All New Vario 160 resmi diluncurkan pada tahun lalu.