Walau kecil, tapi baterai ini mampu memberikan tenaga listrik murni dalam kota. Baterai 48V yang terletak di bawah kursi dan baterai 12 V yang berperan untuk mengoperasikan sistem listrik pada mesin bensin.

Motor juga tetap memiliki water-cooled dan radiator. Dengan memiliki baterai, Kawasaki Ninja Hybrid bisa menggunakan tenaga listrik murni. Motor juga dilengkapi dengan transmisi semi otomatis.