Meski berubah, tapi enjin terbarunya itu masih memiliki tenaga 88 PS di 6.000 rpm, namun dengan torsi yang lebih besar, yaitu 112,9 Nm di 4.500 rpm. Disalurkan melalui transmisi matik baru yang sudah CVT, ke roda depan.
Toyota mengklaim mesin 3 silinder memiliki keunggulan dan kelebihan, yakni efisien dalam mengolah bahan bakar sehingga konsumsi bensin lebih hemat dan memproduksi torsi lebih tinggi dibandingkan mesin 4 silinder dengan volume sama.
Karakter torsi kuat yang didapatkan sejak putaran mesin rendah tersebut memberikan akselerasi lebih cepat dan sigap dari model sebelumnya tanpa mengorbankan konsumsi bahan bakar. Transmisi CVT baru turut menyumbang efisiensi mesin saat berkendara.
Toyota Agya baru memiliki fitur yang lebih lengkap dari generasi pertamanya yang hadir di 2013, termasuk sistem hiburan baru melalui head unit layar sentuh berukuran 9 inci, dan panel instrumen 7 inci TFT.